Back to PLS Help

Error in batch_create_datamat
naailk
Posted on 11/09/15 18:04:18
Number of posts: 12
naailk posts:

Hello,

I am an ecountering this error when running batch_plsgui:

Error using batch_create_datamat (line 187)
There is error(s) in batch file, please read 'UserGuide.htm' for help
 
Error in batch_plsgui (line 43)
         batch_create_datamat(fid);
 
Here is the the batch script:
 

%%%%% GENERAL SECTION %%%%%

prefix                        COP_B_CAT_09
brain_region            0.15
win_size                8
across_run              1
single_subj             0
      %%%%% END GENERAL SECTION %%%%%
%------------------------------------------------------------------

      %%%%% CONDITION SECTION %%%%%

cond_name                     Animals
ref_scan_onset                0
num_ref_scan                  1

cond_name                     Body
ref_scan_onset                0
num_ref_scan                  1

cond_name                     Scrambled
ref_scan_onset                0
num_ref_scan                  1

cond_name                     Faces
ref_scan_onset                0
num_ref_scan                  1

cond_name                     NMO
ref_scan_onset                0
num_ref_scan                  1

cond_name                     Scene
ref_scan_onset                0
num_ref_scan                  1

cond_name                     Tools
ref_scan_onset                0
num_ref_scan                  1

cond_name                     WordsP
ref_scan_onset                0
num_ref_scan                  1

cond_name                     WordsR

ref_scan_onset                0

num_ref_scan                  1

cond_name                     Abstract
ref_scan_onset                0
num_ref_scan                  1

cond_name                     Null
ref_scan_onset                0
num_ref_scan                  1

cond_name                     NoResponse
ref_scan_onset                0
num_ref_scan                  1

      %%%%% END CONDITION SECTION %%%%%
%------------------------------------------------------------------

      %%%%% RUN SECTION %%%%%

data_files              E:/009/s09.TASK01.clean_ts.scaled.nii
event_onsets            28    30    44    57    82    109   115   126   151   159   196  
event_onsets            22    33    38    58    65    68    90    94    138   155   162   181     
event_onsets            1     13    16    18    27    99    118   146   149   153   202  
event_onsets            62    76    78    81    88    112   141   164   170   174   176   203     
event_onsets            32    37    66    74    79    96    100   189  
event_onsets            12    15    46    51    56    98    117   145   183  
event_onsets            3     42    86    110   129   130   167   169  
event_onsets            9     53    91    105   108   137   140   186  
event_onsets            2     4     5     6     8     20    23    24    26    29    34    35      36    41    54    60    64    70    73    75    83    87    89    92    102   111   113      114   116   119   120   123   127   133   135   143   144   148   157   160   161   172      173   175   180   184   185   188   190   192   194   199   200   201   205   206  
event_onsets            17    25    47    63    101   128   136   208  
event_onsets            7     10    11    14    19    21    31    39    40    43    45    48      49    50    52    55    59    61    67    69    71    72    77    80    84    85    93      95    97    103   104   106   107   121   122   124   125   131   132   134   139   142      147   150   152   154   158   163   165   166   171   177   178   179   182   187   191      193   195   197   198   204   207   209  
event_onsets            0     156   168  

data_files              E:/009/s09.TASK02.clean_ts.scaled.nii
event_onsets            10    31    57    81    84    98    99    103   209  
event_onsets            42    46    95    110   113   130   152   193  
event_onsets            9     39    67    96    105   162   180   185   186  
event_onsets            17    44    73    79    104   121   143   178  
event_onsets            2     13    40    50    59    61    76    118   124   171   183  
event_onsets            22    28    36    52    108   148   159   175   192  
event_onsets            1     4     5     30    43    122   123   163   190   202   205  
event_onsets            47    48    55    70    94    137   147   150   160   168   181   197     
event_onsets            3     20    21    26    27    29    35    41    45    51    53    58      60    63    64    65    66    68    72    74    82    87    89    90    91    93    107      112   114   116   120   138   146   149   151   154   158   167   170   189   194   204     
event_onsets            7     24    32    62    75    102   109   142   144   182   203  
event_onsets            0     6     8     11    12    14    15    16    18    23    25    33      34    37    38    49    54    56    69    71    77    78    80    83    85    86    88      92    97    100   101   106   111   115   119   125   126   127   128   129   131   132      133   134   135   136   139   140   141   145   153   155   156   157   161   164   165      166   169   172   173   174   176   177   179   187   188   191   195   196   198   200      201   206   207   208  
event_onsets            19    117   184   199  

data_files              E:/009/s09.TASK03.clean_ts.scaled.nii
event_onsets            28    80    98    111   129   152   191   193  
event_onsets            18    38    45    51    95    106   110   131   135   156   170  
event_onsets            8     11    17    24    29    34    36    60    69    116   164  
event_onsets            1     7     13    26    31    50    67    72    87    140   169   171      172   198  
event_onsets            9     20    58    77    88    89    132   136   137   165   197  
event_onsets            4     33    48    81    101   107   145   163   174   195   201   204     
event_onsets            22    42    64    108   149   150   177   183  
event_onsets            56    62    65    73    75    86    90    124   139   153   155  
event_onsets            0     3     5     15    16    32    35    41    43    46    47    53      55    63    66    76    82    92    94    96    100   113   115   118   119   121   122      126   141   143   144   147   151   154   158   160   166   168   179   184   186   187      192   202   203   207   209  
event_onsets            21    30    39    54    85    99    109   146   148   175   190  
event_onsets            2     6     10    14    19    23    25    27    37    40    44    49      52    57    59    61    68    70    71    74    78    83    84    91    93    97    102      103   104   105   112   114   117   120   123   125   127   128   130   133   134   142      157   159   162   173   176   178   180   181   182   185   189   194   196   199   200      208  
event_onsets            12    79    138   161   167   188   205  

data_files              E:/009/s09.TASK04.clean_ts.scaled.nii
event_onsets            9     51    63    105   131   133   137   163   200   203  
event_onsets            25    73    80    94    96    111   144   176  
event_onsets            45    47    58    93    179   196   204  
event_onsets            8     55    88    159   168   189  
event_onsets            6     18    70    75    82    124   199  
event_onsets            11    24    114   116   117   157   167   197  
event_onsets            16    23    36    71    74    98    108   112   115   123   205  
event_onsets            19    40    95    134   161   182   187   194  
event_onsets            0     4     10    12    15    21    28    32    37    38    39    41      43    44    46    50    52    60    61    62    64    67    72    78    83    84    85      104   109   118   126   129   142   143   147   148   152   153   155   156   162   174      184   191   193   207  
event_onsets            1     30    31    89    145   178   195   208  
event_onsets            2     3     5     13    14    17    20    26    27    29    33    34      35    42    48    49    53    54    56    57    59    65    66    68    69    76    77      79    81    86    87    90    92    97    99    100   103   106   107   110   113   119      120   121   122   125   127   128   130   132   135   136   139   140   141   146   149      150   151   154   158   160   164   165   166   169   170   171   172   175   180   181      183   185   186   188   192   198   201   202   206  
event_onsets            7     22    91    101   102   138   173   177   190   209  

data_files              E:/009/s09.TASK05.clean_ts.scaled.nii
event_onsets            15    30    69    101   119   167   175   190   197  
event_onsets            2     5     46    60    71    99    146   160   169  
event_onsets            37    59    63    73    89    93    111   138   178   187  
event_onsets            0     24    33    34    41    50    62    65    103   125   155  
event_onsets            28    35    38    51    134   148   156   174  
event_onsets            25    58    83    168   179   185  
event_onsets            8     16    22    57    88    95    96    100   108   124   144   152     
event_onsets            12    76    91    92    97    110   129   204   206  
event_onsets            4     6     10    17    27    32    42    44    48    55    61    64      72    75    81    82    84    85    86    90    94    105   109   114   115   118   130      131   132   133   140   145   150   154   161   165   166   171   172   173   176   180      183   184   191   192   195   196   199   205   207  
event_onsets            23    29    31    36    39    47    87    112   116   121   137   147      186   189  
event_onsets            1     3     7     9     11    13    18    19    20    21    26    40      43    45    49    52    53    56    67    68    70    77    78    79    80    98    102      104   106   107   113   117   120   122   123   126   127   128   136   139   141   143      149   151   153   159   163   164   170   177   181   188   193   198   200   201   202      203  
event_onsets            54    74    135   142   157   158   162   182   194   208   209  

data_files              E:/009/s09.TASK06.clean_ts.scaled.nii
event_onsets            103   138   143   144   159   161   195   205  
event_onsets            7     29    87    133   177   194  
event_onsets            6     52    108   134   170   174   189   200  
event_onsets            73    74    83    92    164   165  
event_onsets            10    20    21    55    63    94    105   115   135   139  
event_onsets            17    35    38    111   132   141   148   149   157   169   206   207     
event_onsets            8     60    67    80    97    127   180   184  
event_onsets            37    42    86    89    109   114   119   146   198   199  
event_onsets            3     4     9     18    24    26    32    34    36    39    44    46      49    51    64    66    68    72    90    96    99    104   106   107   110   113   116      123   126   147   150   151   160   166   171   173   178   181   182   186   192   201      202   204   209  
event_onsets            27    82    84    95    152  
event_onsets            0     1     2     5     11    12    13    14    15    16    19    22      23    25    28    30    31    33    40    43    45    50    53    54    56    58    59      61    62    65    69    70    71    75    78    79    81    85    88    91    93    98      102   112   117   118   120   121   124   125   128   129   130   131   136   137   140      142   145   153   154   155   156   158   162   163   167   168   172   175   179   183      185   187   190   191   193   203   208  
event_onsets            41    47    48    57    76    77    100   122   176   188   196   197     

data_files              E:/009/s09.TASK07.clean_ts.scaled.nii
event_onsets            0     2     24    33    103   105   108   114   123   137   139   144      158  
event_onsets            1     3     19    20    40    64    66    84    100   168   176   186      195  
event_onsets            21    55    74    81    109   128   201  
event_onsets            25    43    48    53    72    75    86    121   138   142   200  
event_onsets            26    42    57    67    117   127   185  
event_onsets            31    41    89    106   112   118   153   154   171   181   184   190     
event_onsets            6     49    91    94    96    111   126   132   163   194   196   197     
event_onsets            16    17    38    70    73    102   131   149   156   203   205  
event_onsets            7     12    13    14    15    22    27    30    37    44    47    51      54    61    62    71    79    93    97    99    101   115   122   129   135   136   140      143   145   146   147   150   160   161   162   166   169   173   178   188   189   191      193   199   207   209  
event_onsets            35    56    65    90    92    113   124   151   198  
event_onsets            4     5     8     9     10    11    18    23    28    29    32    34      36    39    45    46    50    52    58    59    60    63    68    69    76    77    78      80    82    83    87    88    95    98    104   107   110   116   119   120   125   130      133   134   141   148   152   155   157   159   164   165   167   170   172   174   175      177   179   180   182   183   187   192   202   204   206   208  
event_onsets            85   

data_files              E:/009/s09.TASK08.clean_ts.scaled.nii
event_onsets            47    105   153   160   197   204  
event_onsets            41    59    117   151   152   172   181  
event_onsets            15    37    57    66    67    68    92    101   124   136   147   175      203  
event_onsets            9     42    98    119   127   132   199   201   209  
event_onsets            20    25    36    45    63    75    82    96    140   188   190   192      208  
event_onsets            17    55    56    73    93    123   137   141  
event_onsets            3     11    89    94    102   155   189  
event_onsets            0     1     8     10    38    48    80    130   207  
event_onsets            2     4     6     7     13    14    18    19    21    24    29    31      33    34    35    44    49    51    53    60    61    62    70    74    76    77    79      85    87    88    90    91    99    106   107   112   113   120   135   139   142   144      156   162   168   169   171   176   178   179   180   186   193  
event_onsets            72    78    84    95    103   110   121   122   145   167   206  
event_onsets            5     12    16    22    23    26    27    28    30    32    39    40      43    46    52    54    58    64    65    69    71    81    83    86    97    100   104      108   109   111   114   115   116   118   125   126   128   129   131   133   134   138      143   146   148   149   150   154   157   158   159   161   163   164   165   166   170      173   174   182   183   184   185   187   191   194   195   196   198   200   202   205     
event_onsets            50    177  

data_files              E:/009/s09.TASK09.clean_ts.scaled.nii
event_onsets            82    98    103   126   155   165   169   191  
event_onsets            1     14    21    37    54    95    104   139   160   194  
event_onsets            0     6     31    67    71    120   140   141   143   182   189  
event_onsets            10    35    43    46    51    61    66    73    116   118   121   184      206  
event_onsets            9     40    48    49    78    87    92    131   134   136   146   147      167   175   188   198  
event_onsets            28    32    41    47    86    105   109   151   176   177   196   202      209  
event_onsets            3     17    20    56    74    77    79    128   135   145   157  
event_onsets            15    45    107   114   125   142   163   208  
event_onsets            4     7     16    19    23    24    25    29    33    36    42    52      53    55    57    58    63    65    68    80    83    91    93    94    96    97    100      106   110   112   113   115   129   133   138   149   152   156   158   161   168   170      173   174   178   181   185   201   203   204   205  
event_onsets            5     11    38    39    70    99    119   132   154   183   195  
event_onsets            2     8     12    13    18    22    26    27    30    34    44    50      59    60    62    64    69    72    75    76    81    84    85    88    89    90    101      102   108   111   117   122   123   124   127   130   137   144   148   150   153   159      162   164   166   171   172   179   180   186   187   190   192   193   197   199   200      207  
event_onsets           

data_files              E:/009/s09.TASK10.clean_ts.scaled.nii
event_onsets            24    32    38    42    59    95    97    116   120   148   170   197     
event_onsets            58    118   125   131   135   144   159   171   185   207  
event_onsets            13    16    40    84    108   132   140   146   200  
event_onsets            41    62    63    64    70    173   175  
event_onsets            81    100   156   198  
event_onsets            4     5     68    85    126   172   181  
event_onsets            11    26    46    72    121   122   158   186   205  
event_onsets            15    45    83    92    98    104   106   134   150   167   182   187     
event_onsets            1     6     8     9     19    20    22    23    30    43    44    47      48    50    53    56    57    65    67    71    74    75    80    87    93    99    102      105   110   115   117   119   136   142   143   145   147   149   151   152   161   174      177   178   179   190   196   201   202  
event_onsets            17    31    52    73    91    103   113   133   168  
event_onsets            0     2     3     7     10    12    14    18    21    25    27    28      29    33    34    35    36    37    39    49    51    54    55    60    61    66    69      76    77    78    79    82    86    88    89    90    94    96    101   107   109   111      112   114   123   124   127   128   129   130   137   138   139   141   153   154   155      157   160   162   163   164   165   166   169   176   180   183   184   188   189   191      192   193   194   195   199   203   204   206   208   209  
event_onsets           

data_files              E:/009/s09.TASK11.clean_ts.scaled.nii
event_onsets            33    41    74    90    91    94    121   136   138   162   185  
event_onsets            1     5     6     35    42    46    55    58    77    93    128   130      146   173   192  
event_onsets            4     13    19    20    24    56    76    110   174   195   196   209     
event_onsets            7     25    50    97    116   134   151   158   159   184  
event_onsets            2     21    37    52    120   127   139   169   191   208  
event_onsets            10    30    44    68    73    86    102   112   160   161   166   168      181  
event_onsets            15    31    34    40    43    114   135   141   149   178   179   198     
event_onsets            26    61    64    131   133   143   153  
event_onsets            0     11    14    17    18    22    27    36    45    47    49    51      54    59    60    66    70    75    80    81    82    84    89    92    100   106   113      117   118   122   126   140   150   157   163   167   171   175   176   182   186   189      190   194   199   201   205   206  
event_onsets            9     23    57    62    69    99    105   108   119   180   202   207     
event_onsets            3     8     12    16    28    29    32    38    39    48    53    63      65    67    71    72    78    79    83    85    87    88    95    96    98    101   103      104   107   109   111   115   123   124   125   129   132   137   142   144   145   147      148   152   154   155   156   164   165   170   172   177   183   187   188   193   197      200   203   204  
event_onsets           

data_files              E:/009/s09.TASK12.clean_ts.scaled.nii
event_onsets            13    31    35    39    74    78    143   179   203  
event_onsets            22    42    85    168   205  
event_onsets            45    51    69    76    82    100   153   157  
event_onsets            12    17    23    47    50    53    112   121   172   183  
event_onsets            46    54    92    109   113   125   162   169   181   209  
event_onsets            61    81    118   129   132   151   195  
event_onsets            11    56    57    58  

Replies:

Untitled Post
naailk
Posted on 11/09/15 18:13:59
Number of posts: 12
naailk replies:

I have just realized the problem. There are empty event onsets in the failed scripts.




Login to reply to this topic.

Contact Us:

3560 Bathurst Street
Toronto, Ontario
Canada M6A 2E1
Phone: (416) 785-2500

Baycrest is an academic health sciences centre fully affiliated with the University of Toronto